北京市东城区疾病预防控制中心（原东城区卫生防疫站）是根据国家卫生防病机构改革精神成立的区级卫生事业单位，位于北京市东城区北兵马司胡同5号。1999年在原址进行翻建，新建后的中心保留了原有的四合院建筑风貌，建筑面积5410平方米。

中心坚持“预防为主”的方针，应用预防医学理论、技术，进行预防、控制和消灭疾病、改善卫生状况，增进人民健康，以促进经济发展和社会稳定，是区政府 和区卫生局的参谋部门，是全区疾病预防与控制的业务指导部门。中心常年承担辖区内各种传染病、慢性非传染性疾病、职业病的预防控制，劳动卫生与放射防护， 学生常见病防治，消毒与病媒生物及医学昆虫防治，健康教育，食品、公共场所、涉水产品、一次性医疗、卫生用品等对影响人体健康的相关产品进行卫生学检测评 价，建设项目预防性卫生学评价，食品与公共场所从业人员健康体检与培训，同时参与并承担传染病暴发疫情、食物中毒、急性职业中毒及生活饮用水污染等突发事 件的调查处理及控制。
东城区疾病预防控制中心同时作为东城区卫生检测检验中心，拥有一支技术过硬的卫生检验队伍和一套先进的检验设备，现有用于检验的仪器设备166台件。 为了及时、安全地处理传染病疫情等突发事件，特购置了3台Esco公司生产的Airstream系列A2型外排二级生物安全柜。目前，Esco安全柜仍保 持良好的安全性能和工作状态，获得了检验工作人员和专家们的一致好评。